En la actualidad Esumer cuenta con cuatro grupos de investigación en funcionamiento, en prospectiva, sistematización de experiencias de desarrollo empresarial local, estudios internacionales y mercadeo, y dos grupos concebidos como proyectos a iniciar enfocados al estudio en logística e historia empresarial.

El Grupo de investigación en prospectiva, registrado en Colciencias, posee una trayectoria de siete años, en los cuales ha realizado varias investigaciones sobre temas aplicados a la prospectiva empresarial, sectorial y de ciudad

El Grupo de investigación en sistematización de experiencias de desarrollo empresarial local, en proceso de registro ante Colciencias, cuenta con una trayectoria de cuatro años, durante los que ha realizado investigaciones de sistematización de proyectos como Prodes de ACOPI, Medellín mi Empresa, proyecto de Asesoría y acompañamiento empresarial a pequeñas unidades productivas informales de Medellín, Componente de Iniciación y Fortalecimiento Empresarial-CIFE, implementación de los Circuitos Económicos Solidarios, entre otros.

El Grupo de investigación en estudios internacionales, en proceso de registro ante Colciencias, comenzó a operar en septiembre de 2007. Durante este tiempo el grupo ha presentado proyectos y ponencias a nivel nacional e internacional.

El Grupo de investigación en mercadeo, en proceso de registro ante Colciencias, fue creado en 2006 y sus áreas de estudio son las ciencias sociales aplicadas, administración, sociales y humanas, desarrollo tecnológico industrial y calidad. El grupo tiene definidas dos líneas investigativas: Desarrollo teórico conceptual del marketing y Desarrollo y mejoramiento de métodos, técnicas y herramientas de aplicación en marketing